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1.海洋人文社會科學導論
本課程利用台東現地海洋自然與人文環境之教學資源，結合台灣西部海洋文化與保育成果之教學資源，以講授為主軸，並輔以2天1夜體驗海洋的戶外課程，再以專題討論、論壇及期末報告方式促進同學們合作、討論及統整學習內容，以轉化為自己的情感、思想、知識、能力及行動力。
2. 海洋系統科學導論
本課程內容包含「海水的特性、海洋溫鹽、密度的時空分佈及海洋環流、海洋波動、海洋觀測、海氣交互作用、海洋形貌與板塊構造、海洋沈積物與沈積構造、海洋環境變遷、海洋生態與物質循環、海洋汙染與環境問題、海洋科技」等課題以令學生能習得海洋科學的整體知識。各課題配合臺灣與全球性之議題，期中並安排野外課程，讓學生瞭解海洋與人類生活的緊密關係。
3. 海洋生命科學導論
以主題說明、議題討論、野外實察、影片介紹、基礎實驗、等方式將海洋生物含動、植、微生物、及生物多樣性、生態系、生態保育、海洋生技及其產業、海水養殖、人類開發對海洋生物之影響、臺東沿岸生態導覽、台東深層海水開發對海岸生態之影響等逐一介紹。
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